Từ tháng 10/2016, để có mặt bằng xây dựng khu Trung tâm Sơ sinh 9 tầng, Bệnh viện đã phải phá dỡ toàn bộ khu nhà trên
diện tích 1.000m2 phía góc đường Trần Quang Khải, Lê Đại Hành. Vì vậy, cơ sở hạ tầng, buồng bệnh phục vụ cho công tác điều trị phải thu hẹp lại.